Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Csrnp3P59055 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms