Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr8P58682 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr8P58682 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr8P58682 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms