Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NcstnP57716 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcstnP57716 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms