Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms