Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf5P56477 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf5P56477 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms