Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms