Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp5P56399 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp5P56399 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp5P56399 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms