Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms