Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms