Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ephb3P54754 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms