Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cacnb3P54285 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms