Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux1P53564 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux1P53564 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux1P53564 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux1P53564 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux1P53564 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux1P53564 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux1P53564 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux1P53564 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cux1P53564 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms