Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Upp1P52624 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms