Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClgnP52194 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClgnP52194 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms