Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TubP50586 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TubP50586 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TubP50586 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TubP50586 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TubP50586 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TubP50586 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TubP50586 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TubP50586 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TubP50586 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TubP50586 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TubP50586 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TubP50586 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TubP50586 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TubP50586 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TubP50586 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TubP50586 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TubP50586 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TubP50586 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TubP50586 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TubP50586 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TubP50586 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms