Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms