Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms