Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms