Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prox1P48437 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms