Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Igfbp6P47880 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp6P47880 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms