Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg3P47867 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg3P47867 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg3P47867 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg3P47867 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg3P47867 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms