Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SrprbP47758 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrprbP47758 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms