Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax9P47242 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms