Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms