Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbP41155 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtbP41155 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbP41155 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbP41155 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbP41155 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbP41155 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbP41155 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbP41155 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LtbP41155 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LtbP41155 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbP41155 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms