Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd9P40240 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd9P40240 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms