Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cap1P40124 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cap1P40124 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cap1P40124 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms