Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms