Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PpargP37238 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PpargP37238 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PpargP37238 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PpargP37238 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PpargP37238 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PpargP37238 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpargP37238 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpargP37238 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpargP37238 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpargP37238 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms