Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprkP35822 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprkP35822 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprkP35822 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PtprkP35822 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms