Protein–RNA interactions for Protein: P35492

Hal, Histidine ammonia-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HalP35492 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HalP35492 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HalP35492 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HalP35492 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HalP35492 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HalP35492 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HalP35492 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HalP35492 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HalP35492 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HalP35492 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HalP35492 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HalP35492 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HalP35492 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HalP35492 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HalP35492 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HalP35492 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms