Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab23P35288 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms