Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms