Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp12P34960 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms