Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptk2P34152 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptk2P34152 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms