Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifnar1P33896 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms