Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KrasP32883 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KrasP32883 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KrasP32883 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KrasP32883 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KrasP32883 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KrasP32883 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KrasP32883 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KrasP32883 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KrasP32883 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KrasP32883 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KrasP32883 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KrasP32883 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KrasP32883 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KrasP32883 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KrasP32883 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KrasP32883 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KrasP32883 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KrasP32883 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KrasP32883 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KrasP32883 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KrasP32883 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KrasP32883 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KrasP32883 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KrasP32883 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KrasP32883 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KrasP32883 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KrasP32883 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KrasP32883 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KrasP32883 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KrasP32883 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KrasP32883 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KrasP32883 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KrasP32883 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KrasP32883 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KrasP32883 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms