Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f3P31361 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms