Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tacr1P30548 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms