Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msr1P30204 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms