Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcdP28867 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms