Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprmP28828 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprmP28828 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprmP28828 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprmP28828 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprmP28828 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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