Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms