Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms