Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfraP26618 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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