Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LynP25911 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LynP25911 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LynP25911 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LynP25911 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LynP25911 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LynP25911 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LynP25911 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LynP25911 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LynP25911 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LynP25911 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LynP25911 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LynP25911 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LynP25911 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms