Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NdnP25233 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NdnP25233 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NdnP25233 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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