Protein–RNA interactions for Protein: P23798

Pcgf2, Polycomb group RING finger protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf2P23798 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf2P23798 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf2P23798 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms