Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfyaP23708 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms