Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3aP23116 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3aP23116 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms